PyArrow の機能#

pandasはPyArrowを利用して機能を拡張し、様々なAPIのパフォーマンスを向上させることができます。これには以下が含まれます。

  • NumPyと比較して、より広範なデータ型

  • すべてのデータ型に対する欠損データサポート(NA)

  • 高性能なIOリーダー統合

  • Apache Arrow仕様に基づく他のデータフレームライブラリ(例:polars、cuDF)との相互運用性を促進

この機能を使用するには、サポートされている最小限のPyArrowバージョンをインストールしてください。

データ構造の統合#

SeriesIndex、またはDataFrameの列は、NumPy配列に似たpyarrow.ChunkedArrayによって直接バッキングできます。pandasの主要なデータ構造からこれらを構築するには、型の文字列に続けて[pyarrow](例:"int64[pyarrow]"")をdtypeパラメータに渡します。

In [1]: ser = pd.Series([-1.5, 0.2, None], dtype="float32[pyarrow]")

In [2]: ser
Out[2]: 
0    -1.5
1     0.2
2    <NA>
dtype: float[pyarrow]

In [3]: idx = pd.Index([True, None], dtype="bool[pyarrow]")

In [4]: idx
Out[4]: Index([True, <NA>], dtype='bool[pyarrow]')

In [5]: df = pd.DataFrame([[1, 2], [3, 4]], dtype="uint64[pyarrow]")

In [6]: df
Out[6]: 
   0  1
0  1  2
1  3  4

注記

文字列エイリアス"string[pyarrow]"は、pd.StringDtype("pyarrow")にマップされます。これはdtype=pd.ArrowDtype(pa.string())を指定することと同等ではありません。pd.StringDtype("pyarrow")はNumPyでバッキングされたNull許容型を返すことができ、pd.ArrowDtype(pa.string())ArrowDtypeを返すことを除いて、一般的にデータの操作は同様に動作します。

In [7]: import pyarrow as pa

In [8]: data = list("abc")

In [9]: ser_sd = pd.Series(data, dtype="string[pyarrow]")

In [10]: ser_ad = pd.Series(data, dtype=pd.ArrowDtype(pa.string()))

In [11]: ser_ad.dtype == ser_sd.dtype
Out[11]: False

In [12]: ser_sd.str.contains("a")
Out[12]: 
0     True
1    False
2    False
dtype: boolean

In [13]: ser_ad.str.contains("a")
Out[13]: 
0     True
1    False
2    False
dtype: bool[pyarrow]

パラメータを受け入れるPyArrow型の場合、それらのパラメータを持つPyArrow型をArrowDtypeに渡して、dtypeパラメータで使用できます。

In [14]: import pyarrow as pa

In [15]: list_str_type = pa.list_(pa.string())

In [16]: ser = pd.Series([["hello"], ["there"]], dtype=pd.ArrowDtype(list_str_type))

In [17]: ser
Out[17]: 
0    ['hello']
1    ['there']
dtype: list<item: string>[pyarrow]
In [18]: from datetime import time

In [19]: idx = pd.Index([time(12, 30), None], dtype=pd.ArrowDtype(pa.time64("us")))

In [20]: idx
Out[20]: Index([12:30:00, <NA>], dtype='time64[us][pyarrow]')
In [21]: from decimal import Decimal

In [22]: decimal_type = pd.ArrowDtype(pa.decimal128(3, scale=2))

In [23]: data = [[Decimal("3.19"), None], [None, Decimal("-1.23")]]

In [24]: df = pd.DataFrame(data, dtype=decimal_type)

In [25]: df
Out[25]: 
      0      1
0  3.19   <NA>
1  <NA>  -1.23

すでにpyarrow.Arrayまたはpyarrow.ChunkedArrayがある場合は、それをarrays.ArrowExtensionArrayに渡して、関連付けられたSeriesIndexまたはDataFrameオブジェクトを構築できます。

In [26]: pa_array = pa.array(
   ....:     [{"1": "2"}, {"10": "20"}, None],
   ....:     type=pa.map_(pa.string(), pa.string()),
   ....: )
   ....: 

In [27]: ser = pd.Series(pd.arrays.ArrowExtensionArray(pa_array))

In [28]: ser
Out[28]: 
0      [('1', '2')]
1    [('10', '20')]
2              <NA>
dtype: map<string, string>[pyarrow]

SeriesまたはIndexからpyarrowのpyarrow.ChunkedArrayを取得するには、SeriesまたはIndexでpyarrow配列コンストラクターを呼び出すことができます。

In [29]: ser = pd.Series([1, 2, None], dtype="uint8[pyarrow]")

In [30]: pa.array(ser)
Out[30]: 
<pyarrow.lib.UInt8Array object at 0x7fac4d182ec0>
[
  1,
  2,
  null
]

In [31]: idx = pd.Index(ser)

In [32]: pa.array(idx)
Out[32]: 
<pyarrow.lib.UInt8Array object at 0x7fac4d593b80>
[
  1,
  2,
  null
]

pyarrow.TableDataFrameに変換するには、pyarrow.Table.to_pandas()メソッドをtypes_mapper=pd.ArrowDtypeで呼び出すことができます。

In [33]: table = pa.table([pa.array([1, 2, 3], type=pa.int64())], names=["a"])

In [34]: df = table.to_pandas(types_mapper=pd.ArrowDtype)

In [35]: df
Out[35]: 
   a
0  1
1  2
2  3

In [36]: df.dtypes
Out[36]: 
a    int64[pyarrow]
dtype: object

操作#

PyArrowデータ構造の統合は、pandasのExtensionArray インターフェースを介して実装されています。そのため、このインターフェースがpandas API内に統合されている場合に、サポートされる機能が存在します。さらに、この機能は、可能な場合はPyArrowの計算関数で高速化されます。これには以下が含まれます。

  • 数値の集計

  • 数値演算

  • 数値の丸め

  • 論理関数と比較関数

  • 文字列関数

  • 日付時刻関数

以下は、ネイティブのPyArrow計算関数によって高速化される操作のほんの一例です。

In [37]: import pyarrow as pa

In [38]: ser = pd.Series([-1.545, 0.211, None], dtype="float32[pyarrow]")

In [39]: ser.mean()
Out[39]: -0.6669999808073044

In [40]: ser + ser
Out[40]: 
0    -3.09
1    0.422
2     <NA>
dtype: float[pyarrow]

In [41]: ser > (ser + 1)
Out[41]: 
0    False
1    False
2     <NA>
dtype: bool[pyarrow]

In [42]: ser.dropna()
Out[42]: 
0   -1.545
1    0.211
dtype: float[pyarrow]

In [43]: ser.isna()
Out[43]: 
0    False
1    False
2     True
dtype: bool

In [44]: ser.fillna(0)
Out[44]: 
0   -1.545
1    0.211
2      0.0
dtype: float[pyarrow]
In [45]: ser_str = pd.Series(["a", "b", None], dtype=pd.ArrowDtype(pa.string()))

In [46]: ser_str.str.startswith("a")
Out[46]: 
0     True
1    False
2     <NA>
dtype: bool[pyarrow]
In [47]: from datetime import datetime

In [48]: pa_type = pd.ArrowDtype(pa.timestamp("ns"))

In [49]: ser_dt = pd.Series([datetime(2022, 1, 1), None], dtype=pa_type)

In [50]: ser_dt.dt.strftime("%Y-%m")
Out[50]: 
0    2022-01
1       <NA>
dtype: string[pyarrow]

I/O 読み込み#

PyArrowは、いくつかのpandas IOリーダーに統合されているIO読み込み機能も提供します。以下の関数は、PyArrowにディスパッチしてIOソースからの読み込みを高速化できるengineキーワードを提供します。

In [51]: import io

In [52]: data = io.StringIO("""a,b,c
   ....:    1,2.5,True
   ....:    3,4.5,False
   ....: """)
   ....: 

In [53]: df = pd.read_csv(data, engine="pyarrow")

In [54]: df
Out[54]: 
   a    b      c
0  1  2.5   True
1  3  4.5  False

デフォルトでは、これらの関数と他のすべてのIOリーダー関数はNumPyでバッキングされたデータを返します。これらのリーダーは、パラメータdtype_backend="pyarrow"を指定することで、PyArrowでバッキングされたデータを返すことができます。リーダーは、PyArrowでバッキングされたデータを返すために、必ずしもengine="pyarrow"を設定する必要はありません。

In [55]: import io

In [56]: data = io.StringIO("""a,b,c,d,e,f,g,h,i
   ....:     1,2.5,True,a,,,,,
   ....:     3,4.5,False,b,6,7.5,True,a,
   ....: """)
   ....: 

In [57]: df_pyarrow = pd.read_csv(data, dtype_backend="pyarrow")

In [58]: df_pyarrow.dtypes
Out[58]: 
a     int64[pyarrow]
b    double[pyarrow]
c      bool[pyarrow]
d    string[pyarrow]
e     int64[pyarrow]
f    double[pyarrow]
g      bool[pyarrow]
h    string[pyarrow]
i      null[pyarrow]
dtype: object

以下のようないくつかの非IOリーダー関数も、dtype_backend引数を使用してPyArrowでバッキングされたデータを返すことができます。